Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P04212 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P04212 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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P04212 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P04212 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
P04212 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P04212 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P04212 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P04212 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P04212 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P04212 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
P04212 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P04212 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P04212 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P04212 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P04212 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P04212 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P04212 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
P04212 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P04212 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P04212 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P04212 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P04212 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
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