Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Stra6O70491 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stra6O70491 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stra6O70491 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Stra6O70491 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Stra6O70491 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Stra6O70491 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Stra6O70491 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Stra6O70491 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Stra6O70491 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Stra6O70491 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stra6O70491 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stra6O70491 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Stra6O70491 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stra6O70491 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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