Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp4O70480 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms