Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Degs1O09005 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Degs1O09005 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Degs1O09005 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Degs1O09005 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Degs1O09005 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Degs1O09005 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Degs1O09005 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Degs1O09005 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Degs1O09005 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Degs1O09005 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Degs1O09005 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Degs1O09005 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Degs1O09005 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Degs1O09005 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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