Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
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Gm20878L7N244 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Gm20878L7N244 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Gm20878L7N244 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20878L7N244 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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