Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm8356J3QPD3 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm8356J3QPD3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm8356J3QPD3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm8356J3QPD3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm8356J3QPD3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm8356J3QPD3 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm8356J3QPD3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm8356J3QPD3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm8356J3QPD3 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm8356J3QPD3 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm8356J3QPD3 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm8356J3QPD3 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm8356J3QPD3 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm8356J3QPD3 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm8356J3QPD3 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm8356J3QPD3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm8356J3QPD3 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm8356J3QPD3 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm8356J3QPD3 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm8356J3QPD3 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm8356J3QPD3 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm8356J3QPD3 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm8356J3QPD3 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm8356J3QPD3 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8356J3QPD3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms