Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP8

Gm21863, Predicted gene, 21863, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21863J3KMP8 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21863J3KMP8 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21863J3KMP8 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21863J3KMP8 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21863J3KMP8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21863J3KMP8 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21863J3KMP8 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21863J3KMP8 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21863J3KMP8 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21863J3KMP8 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21863J3KMP8 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21863J3KMP8 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21863J3KMP8 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21863J3KMP8 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21863J3KMP8 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21863J3KMP8 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21863J3KMP8 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm21863J3KMP8 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21863J3KMP8 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms