Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ3

Usp32, Ubiquitin-specific peptidase 32, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp32F8VPZ3 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp32F8VPZ3 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms