Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M1F7CXU4 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms