Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Gm28048F7BCN0 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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