Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Igkv1-99F6XWB2 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
Igkv1-99F6XWB2 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms