Protein–RNA interactions for Protein: E9Q166

Atad2b, ATPase family, AAA domain-containing 2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2bE9Q166 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atad2bE9Q166 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atad2bE9Q166 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atad2bE9Q166 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atad2bE9Q166 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atad2bE9Q166 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atad2bE9Q166 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Atad2bE9Q166 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atad2bE9Q166 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atad2bE9Q166 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Atad2bE9Q166 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atad2bE9Q166 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atad2bE9Q166 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Atad2bE9Q166 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Atad2bE9Q166 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atad2bE9Q166 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atad2bE9Q166 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atad2bE9Q166 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atad2bE9Q166 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atad2bE9Q166 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atad2bE9Q166 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atad2bE9Q166 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atad2bE9Q166 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atad2bE9Q166 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atad2bE9Q166 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atad2bE9Q166 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atad2bE9Q166 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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