Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
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Gm3543D3Z235 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Gm3543D3Z235 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Gm3543D3Z235 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Gm3543D3Z235 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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