Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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