Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spocd1B1ASB6 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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