Protein–RNA interactions for Protein: A2AEN9

Gm5938, Predicted gene 5938, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5938A2AEN9 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5938A2AEN9 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5938A2AEN9 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5938A2AEN9 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5938A2AEN9 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5938A2AEN9 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5938A2AEN9 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5938A2AEN9 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5938A2AEN9 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5938A2AEN9 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5938A2AEN9 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5938A2AEN9 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5938A2AEN9 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5938A2AEN9 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5938A2AEN9 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5938A2AEN9 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5938A2AEN9 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5938A2AEN9 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5938A2AEN9 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5938A2AEN9 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5938A2AEN9 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5938A2AEN9 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5938A2AEN9 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5938A2AEN9 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5938A2AEN9 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5938A2AEN9 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5938A2AEN9 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5938A2AEN9 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5938A2AEN9 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5938A2AEN9 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5938A2AEN9 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5938A2AEN9 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5938A2AEN9 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5938A2AEN9 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5938A2AEN9 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5938A2AEN9 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5938A2AEN9 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5938A2AEN9 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5938A2AEN9 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5938A2AEN9 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5938A2AEN9 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms