Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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