Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms