Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms