Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl39Q9JKF7 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms