Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms