Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Tfpi-201ENSMUST00000028487 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Fam216b-201ENSMUST00000066437 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Gm14795-201ENSMUST00000118461 471 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Coa4-202ENSMUST00000120454 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Gm14817-201ENSMUST00000148522 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Gm21083-201ENSMUST00000188807 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 A330074H02Rik-201ENSMUST00000194667 1039 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Gm46103-201ENSMUST00000217614 341 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Vmn1r17-202ENSMUST00000227966 912 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Olfr917-201ENSMUST00000076542 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Vmn1r42-201ENSMUST00000089419 1098 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Olfr1432-202ENSMUST00000207710 2068 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Gm3532-201ENSMUST00000181880 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Gm17132-201ENSMUST00000109542 1158 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Gm15176-201ENSMUST00000117734 135 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 8430436N08Rik-201ENSMUST00000129988 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 1700086P04Rik-201ENSMUST00000149472 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Vmn1r-ps74-201ENSMUST00000173518 570 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Ranbp2-ps8-201ENSMUST00000183723 345 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Gm18452-201ENSMUST00000202968 1111 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Riok3Q9DBU3 Pln-203ENSMUST00000218468 760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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