Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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SlirpQ9D8T7 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SlirpQ9D8T7 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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