Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp4bQ9D8B3 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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