Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms