Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn23Q9D7D7 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms