Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2al3Q9D4U4 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms