Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Krt20Q9D312 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms