Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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