Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms