Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim26Q99PN3 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms