Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrbp1Q99PL5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Rrbp1Q99PL5 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rrbp1Q99PL5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rrbp1Q99PL5 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rrbp1Q99PL5 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rrbp1Q99PL5 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrbp1Q99PL5 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrbp1Q99PL5 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrbp1Q99PL5 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrbp1Q99PL5 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrbp1Q99PL5 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrbp1Q99PL5 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrbp1Q99PL5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrbp1Q99PL5 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrbp1Q99PL5 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrbp1Q99PL5 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrbp1Q99PL5 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrbp1Q99PL5 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrbp1Q99PL5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrbp1Q99PL5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrbp1Q99PL5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrbp1Q99PL5 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrbp1Q99PL5 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrbp1Q99PL5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrbp1Q99PL5 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrbp1Q99PL5 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrbp1Q99PL5 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrbp1Q99PL5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrbp1Q99PL5 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrbp1Q99PL5 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrbp1Q99PL5 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrbp1Q99PL5 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrbp1Q99PL5 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrbp1Q99PL5 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrbp1Q99PL5 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrbp1Q99PL5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms