Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ubqln4Q99NB8 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ubqln4Q99NB8 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Ubqln4Q99NB8 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.1 ms