Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
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TrabdQ99JY4 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
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TrabdQ99JY4 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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TrabdQ99JY4 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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TrabdQ99JY4 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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TrabdQ99JY4 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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TrabdQ99JY4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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TrabdQ99JY4 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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TrabdQ99JY4 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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