Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Smim11aQ99J19 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Smim11aQ99J19 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Smim11aQ99J19 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Smim11aQ99J19 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim11aQ99J19 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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