Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Med28Q920D3 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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