Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q8VDP2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8VDP2 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VDP2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VDP2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VDP2 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VDP2 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VDP2 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VDP2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms