Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam20bQ8VCS3 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms