Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn4Q8VCH8 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubxn4Q8VCH8 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms