Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Hpf1Q8CFE2 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Hpf1Q8CFE2 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Hpf1Q8CFE2 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Hpf1Q8CFE2 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Hpf1Q8CFE2 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Hpf1Q8CFE2 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Hpf1Q8CFE2 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Hpf1Q8CFE2 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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