Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubqln3Q8C5U9 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubqln3Q8C5U9 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubqln3Q8C5U9 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ubqln3Q8C5U9 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms