Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ube3dQ8BX13 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ube3dQ8BX13 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ube3dQ8BX13 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ube3dQ8BX13 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ube3dQ8BX13 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ube3dQ8BX13 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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