Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Zbtb40Q6PCS8 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms