Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

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Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
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Sbno1Q689Z5 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
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Sbno1Q689Z5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Sbno1Q689Z5 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Sbno1Q689Z5 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Sbno1Q689Z5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Sbno1Q689Z5 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Sbno1Q689Z5 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Sbno1Q689Z5 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Sbno1Q689Z5 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Sbno1Q689Z5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Sbno1Q689Z5 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Sbno1Q689Z5 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Sbno1Q689Z5 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Sbno1Q689Z5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Sbno1Q689Z5 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Sbno1Q689Z5 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
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Sbno1Q689Z5 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Sbno1Q689Z5 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbno1Q689Z5 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sbno1Q689Z5 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sbno1Q689Z5 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms