Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tfap2bQ61313 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.5 ms