Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf3Q60765 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms