Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf123Q5XPI3 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf123Q5XPI3 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms