Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms