Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Trim58Q5NCC9 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Trim58Q5NCC9 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Trim58Q5NCC9 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Trim58Q5NCC9 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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Trim58Q5NCC9 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Trim58Q5NCC9 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Trim58Q5NCC9 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Trim58Q5NCC9 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Trim58Q5NCC9 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Trim58Q5NCC9 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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