Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTM8

Rnf20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, mousemouse

Predictions only

Length 973 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf20Q5DTM8 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf20Q5DTM8 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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